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现有一套房子没有房产证，是单位房，我是兄弟俩，现在爸爸把房子给我，而且去问过公证处，他们说没有房产证不给公证，那么爸爸给我们写了一份协议书，我想咨询一下，如果以后害怕和哥哥发生纠纷，这样管用吗？怎样才能得到合法的权益。